Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccp110Q7TSH4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccp110Q7TSH4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms