Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSA6

Proser3, Proline and serine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser3Q7TSA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Proser3Q7TSA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Proser3Q7TSA6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Proser3Q7TSA6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms