Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip1Q7TMB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyfip1Q7TMB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyfip1Q7TMB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms