Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eci3Q78JN3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eci3Q78JN3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms