Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed3Q78IS1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed3Q78IS1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms