Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssh1Q76I79 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh1Q76I79 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms