Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nme8Q715T0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nme8Q715T0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nme8Q715T0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms