Protein–RNA interactions for Protein: Q70FJ1

Akap9, A-kinase anchor protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 3,797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap9Q70FJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Akap9Q70FJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Akap9Q70FJ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Akap9Q70FJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Akap9Q70FJ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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Akap9Q70FJ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Akap9Q70FJ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms