Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SpopQ6ZWS8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SpopQ6ZWS8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SpopQ6ZWS8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms