Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Topbp1Q6ZQF0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Topbp1Q6ZQF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Topbp1Q6ZQF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms