Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms