Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf653Q6YND2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf653Q6YND2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms