Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M2Q6W9L1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M2Q6W9L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms