Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn5Q6VZZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn5Q6VZZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms