Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms