Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9c1Q6UJY2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9c1Q6UJY2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms