Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casc1Q6TDU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms