Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300lfQ6SJQ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms