Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NfrkbQ6PIJ4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfrkbQ6PIJ4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfrkbQ6PIJ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms