Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc57Q6PHN1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc57Q6PHN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc57Q6PHN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms