Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGL7

Washc2, WASH complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc2Q6PGL7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Washc2Q6PGL7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Washc2Q6PGL7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Washc2Q6PGL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms