Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc82Q6PG04 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc82Q6PG04 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms