Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc2Q6PDG5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc2Q6PDG5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms