Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim37Q6PCX9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms