Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab2Q6PAM0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab2Q6PAM0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkab2Q6PAM0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms