Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BcrQ6PAJ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BcrQ6PAJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcrQ6PAJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms