Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp49Q6P9L4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp49Q6P9L4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms