Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Alkbh2Q6P6J4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alkbh2Q6P6J4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms