Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casc4Q6P2L7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casc4Q6P2L7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms