Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrimpolQ6P1E7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrimpolQ6P1E7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms