Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpbp1Q6NXH3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpbp1Q6NXH3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms