Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tvp23aQ6NVH0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23aQ6NVH0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms