Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pdcd11Q6NS46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pdcd11Q6NS46 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms