Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp7Q6A4J8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp7Q6A4J8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp7Q6A4J8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp7Q6A4J8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp7Q6A4J8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp7Q6A4J8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp7Q6A4J8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms