Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK9

Nlgn2, Neuroligin-2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn2Q69ZK9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn2Q69ZK9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlgn2Q69ZK9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlgn2Q69ZK9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn2Q69ZK9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms