Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Msl2Q69ZF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms