Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp4Q68FH0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkp4Q68FH0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms