Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptbn2Q68FG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms