Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CltcQ68FD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CltcQ68FD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltcQ68FD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltcQ68FD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms