Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Top2bQ64511 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Top2bQ64511 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Top2bQ64511 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Top2bQ64511 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Top2bQ64511 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2bQ64511 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2bQ64511 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Top2bQ64511 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2bQ64511 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2bQ64511 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Top2bQ64511 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2bQ64511 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2bQ64511 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2bQ64511 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.8■■■■□ 3
Top2bQ64511 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2bQ64511 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Top2bQ64511 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Top2bQ64511 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Top2bQ64511 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Top2bQ64511 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2bQ64511 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Top2bQ64511 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2bQ64511 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms