Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ccdc18Q640L5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccdc18Q640L5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc18Q640L5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc18Q640L5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33■■■□□ 2.87
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