Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a5Q63ZW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a5Q63ZW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a5Q63ZW6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms