Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zic2Q62520 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zic2Q62520 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zic2Q62520 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms