Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad2Q62432 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smad2Q62432 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad2Q62432 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad2Q62432 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad2Q62432 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smad2Q62432 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms