Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr2Q62371 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr2Q62371 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr2Q62371 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms