Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TrhQ62361 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrhQ62361 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TrhQ62361 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TrhQ62361 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrhQ62361 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrhQ62361 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms