Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18Q62280 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18Q62280 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms