Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall3Q62255 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall3Q62255 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms