Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms