Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpaQ62189 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpaQ62189 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms